Como recorrer a reprovação de falta, tendo em mãos atestado médico.

Estou prestes a reprovar em uma matéria onde tenho total domínio com notas boas nas provas, porém acabei tendo um problema de saúde e não pude comparecer na aula presencial. Fui ao médico peguei o atestado e mesmo assim tomei falta(eles não aceitaram meu atestado). Com a soma dessa falta, acabei ultrapassando o limite. Como agir nesse caso, pretendo tomar alguma atitude sobre esse assunto.